Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms