Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms