Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hddc2Q3SXD3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms