Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl1Q2VPR5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms