Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim71Q1PSW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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