Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cers3Q1A3B0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms