Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q149G0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q149G0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q149G0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q149G0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q149G0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q149G0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q149G0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q149G0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q149G0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q149G0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms