Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3ip1Q149C2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3ip1Q149C2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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Traf3ip1Q149C2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms