Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms