Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem52bQ0VBF2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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