Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd8Q09XV5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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