Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col17a1Q07563 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms