Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms