Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms