Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms