Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk18Q04899 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms