Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms