Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms