Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms