Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top1Q04750 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms