Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cxcr5Q04683 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms