Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms