Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms