Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina1cQ00896 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms