Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms