Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms