Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms