Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1bP97952 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms