Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cry1P97784 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms