Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx2P97474 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx2P97474 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms