Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nbr1P97432 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nbr1P97432 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms