Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Mesp1P97309 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Mesp1P97309 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mesp1P97309 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms