Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx3P81067 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx3P81067 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms