Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ext2P70428 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ext2P70428 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms