Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps17P63276 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps17P63276 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps17P63276 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps17P63276 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps17P63276 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps17P63276 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps17P63276 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms