Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms