Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crabp1P62965 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crabp1P62965 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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