Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap25P60879 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms