Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms