Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P58686 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P58686 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P58686 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P58686 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P58686 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P58686 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P58686 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P58686 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
P58686 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P58686 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P58686 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms