Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms