Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samsn1P57725 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms