Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms