Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms