Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms