Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2bP55271 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms