Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgd1P52734 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgd1P52734 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms