Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upp1P52624 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms