Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr3P51678 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms