Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa8P50706 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa8P50706 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms